学校拥有附属海南医院（海南省人民医院）、第一、二附属医院以及附属肿瘤医院4所直属附属医院，总床位7800余张，年门、急诊总量453.13万人次，年出院病人24.4万人次。拥有国家临床重点建设专科8个，国家中医药管理局临床重点建设专科2个；国家级住院医师培训基地69个，国家级专科医师培训基地3个。是国家水上应急教育培训基地、国家紧急医学救援队（海南）依托单位，有非直属附属医院5所。
与美国内布拉斯加大学、瑞士巴塞尔大学、新加坡国立大学、泰国玛西隆大学、香港大学、上海交大医学院、中山大学中山医学院、南京医科大学等国内外知名大学建立了合作关系，与美国Samuel Waxman癌症研究基金会、上海瑞金医院联合成立“衰老与癌症国际研究中心”，与英国西英格兰大学中外合作办学项目已正式启动。发起成立了有27个国家和地区120所高校、科研机构参加的“一带一路”热带医学联盟，已举办三届热带医学高峰论坛。
