南京农业大学建有作物遗传与种质创新国家重点实验室、国家肉品质量安全控制工程技术研究中心、国家信息农业工程技术中心、国家大豆改良中心、国家有机类肥料工程技术研究中心、农村土地资源利用与整治国家地方联合工程研究中心、绿色农药创制与应用技术国家地方联合工程研究中心等79个国家及部省级科研平台。“十二五”以来，到位科研经费60多亿元，获得国家及部省级科技成果奖200余项，其中作为第一完成单位获得国家科学技术奖12项。主动服务国家脱贫攻坚、乡村振兴战略，凭借雄厚的科研实力，创造了巨大的经济社会效益，多次被评为“国家科教兴农先进单位”。2017-2019年，连续三届入选教育部直属高校精准扶贫精准脱贫十大典型项目。
南京农业大学积极响应国家“一带一路”倡议，不断提升国际化水平，对外交流日趋活跃，先后与30多个国家和地区的160多所境外高水平大学、研究机构保持着学生联合培养、学术交流和科研合作关系。与美国加州大学戴维斯分校、康奈尔大学、比利时根特大学、新西兰梅西大学等世界知名高校，开展“交流访学”“本科双学位”“本硕双学位”等数十个学生联合培养项目，2019年经教育部批准与美国密西根州立大学合作设立南京农业大学密西根学院。建有“中美食品安全与质量联合研究中心”“中国-肯尼亚作物分子生物学‘一带一路’联合实验室”“动物健康与食品安全”国际合作联合实验室、“动物消化道营养国际联合研究中心”“中英植物表型组学联合研究中心”“南京农业大学-加州大学戴维斯分校全球健康联合研究中心”“亚洲农业研究中心”等多个国际合作平台。2007年，成为教育部“接受中国政府奖学金来华留学生院校”。2008年，成为全国首批“教育援外基地”。2012年，获批建设全球首个农业特色孔子学院。2014年，获外交部、教育部联合批准成立“中国-东盟教育培训中心”。2012年倡议发起设立“世界农业奖”，已连续8届分别向来自康奈尔大学、加州大学戴维斯分校、俄亥俄州立大学、波恩大学、阿尔伯塔大学、比利时根特大学、加纳大学和智利天主教大学等高校的10位获奖者颁发奖项。
南京农业大学拥有卫岗校区、浦口校区和白马教学科研基地，总面积9平方公里，建筑面积74万平方米，图书资料收藏量235万册（部），外文期刊1万余种和中文电子图书500余万种。2014年，与Nature集团合办学术期刊Horticulture Research，并于2019年入选中国科技期刊“卓越计划”领军类期刊；2018年，与Science集团合办学术期刊Plant Phenomics；2019年，与Science集团合办学术期刊BioDesign Research。
展望未来，作为近现代中国高等农业教育的拓荒者，南京农业大学将以立德树人为根本，以强农兴农为己任，加强内涵建设，聚力改革创新，服务国家战略需求，着力培养知农爱农新型人才，全面开启农业特色世界一流大学建设的崭新征程！
